Emilio Montesinos és actualment catedràtic de Patologia Vegetal i Microbiologia a la Universitat de Girona (Espanya) (des de 1986),  investigador visitant a l’INRA (Angers, França) (1990) i Departament de Patologia Vegetal de la Cornell University (Ithaca, NY, EUA) (1994). La seva àrea d’investigació i desenvolupament se centra en la patologia vegetal (Epidemiologia i control biològic), en el camp dels bioplaguicides (microorganismes beneficiosos i pèptids inductors de defenses en les plantes i antimicrobians), per al control de bacteris de quarantena de plantes d’importància econòmica.

És autor de 100 articles científics en revistes SCI (H-index 34) i editor/col·laborador en diversos llibres. Va contribuir al desenvolupament de nous bioplaguicides amb eficàcia provada enfront diverses malalties de les plantes causades per fongs i bacteris, i algunes d’elles estan en explotació. És inventor de diverses patents, i ha estat membre de panells d’especialistes al Ministeri d’Agricultura i del grup Plant Health de la European Food Safety Agency  (EFSA). Va ser president de la Sociedad Española de Fitopatología (2000-2004) de la que actualment és membre honorari. Va ser distingit amb la Medalla Narcís Monturiol de la Generalitat de Catalunya per la seva contribució científica a la Sanitat Vegetal (2012).