NUESTROS SERVICIOS
DETECCIÓN E IDENTIFICACIÓN DE PATOGENOS DE PLANTAS
Este servicio se ofrece para la detección directa del patógeno en muestras de campo o su aislamiento e identificación a partir de plantas infectadas, ya sea sintomáticas o asintomáticas. La detección se basa en técnicas de PCR (convencionales, cuantitativas (qPCR), viable-cuantitatives-PCR (v-qPCR) o mediante métodos serológicos (ELISA). Cuando es posible, los patógenos se aíslan en medios de crecimiento adecuados y se identifican mediante métodos microbiológicos, serológicos y moleculares (ribotipado). Además, ofrecemos la optimización de técnicas moleculares para el diagnóstico de patógenos bacterianos y fúngicos de interés. Estamos especializados en bacterias patógenas de plantas principalmente patógenos de cuarentena en la UE como Xylella fastidiosa, Xanthomonas citri, Xanthomonas arboricola pv. pruni, Candidatus Liberibacter (HLB), Pseudomonas savastanoi, Erwinia amylovora, y otros patógenos como Agrobacterium tumefaciens (Rizhobium radiobacter). Además, utilizamos y desarrollamos herramientas para la detección/identificación de hongos patógenos de plantas.
DESARROLLO DE HERRAMIENTAS ESPECÍFICAS DE CEPA PARA EL MONITOREO DE PLAGUICIDAS Y BIOFERTILIZANTES DE ORIGEN MICROBIANO BASADAS EN MARCADORES DE ÁCIDOS NUCLEICOS
Se pueden desarrollar herramientas moleculares para el seguimiento de patógenos bacterianos y fúngicos en plantas, agua, superficies, suelo y otras matrices. La identificación y el control de la cepa son requisitos necesarios para la patentabilidad y para estudios de trazabilidad en alimentos y en campo, y para mejorar su formulación. Ofrecemos una plataforma basada en técnicas no invasivas (no transgénicas) dirigidas a genes marcadores específicos de cepa (ADN o ARN), utilizando técnicas de PCR (qPCR convencional o cuantitativa). En una primera etapa, se estudia el genoma para buscar marcadores específicos de la cepa, ya sea por re-secuenciación o por huellas digitales de ADN (U-PCR, RAPD, RFLPs …). A continuación, los cebadores son diseñados y validados por PCR convencional. Finalmente, se desarrolla un protocolo de PCR en tiempo real que se evalúa y se valida en condiciones reales (material vegetal, suelo, etc.).
CONTROL DE CALIDAD E IDENTIFICACIÓN DE PLAGUICIDAS MICROBIANOS
La identificación taxonómica precisa de la especie microbiana y la caracterización de agentes de biocontrol y biofertilizantes es necesaria para el registro y para establecer su mecanismo de acción. Ofrecemos una amplia gama de sistemas que incluyen pruebas microbiológicas (API, BIOLOG), bioquímicas (perfil de metabolitos por HPLC, espectrometría de masas, etc.) y huellas digitales de ADN (perfil de genes para genes biosintéticos que codifican compuestos antimicrobianos, RAPD, PFGE, MLST, etc.) o incluso secuenciación del genoma. También se realizan pruebas previas de toxicidad, como la fitotoxicidad, la actividad hemolítica, la genotoxicidad (test de Ames) y la toxicidad en nematodos (test de Caenorhabditis elegans).
CARACTERIZACIÓN DE PESTICIDAS MICROBIANOS
La identificación taxonómica precisa de la especie microbiana y la caracterización de agentes de biocontrol y biofertilizantes es necesaria para el registro y para establecer su mecanismo de acción. Ofrecemos una amplia gama de sistemas que incluyen pruebas microbiológicas (API, BIOLOG), bioquímicas (perfil de metabolitos por HPLC, espectrometría de masas, etc.) y huellas digitales de ADN (perfil de genes para genes biosintéticos que codifican compuestos antimicrobianos, RAPD, PFGE, MLST, etc.) o incluso secuenciación del genoma. También se realizan pruebas previas de toxicidad, como la fitotoxicidad, la actividad hemolítica, la genotoxicidad (test de Ames) y la toxicidad en nematodos (test de Caenorhabditis elegans).
PREVENCIÓN Y CONTROL DE ENFERMEDADES CAUSADAS POR BACTERIAS Y HONGOS
Detección de focos de contaminación causados por patógenos vegetales en diferentes etapas de los procesos productivos (por ejemplo, propagación de material vegetal en viveros, contaminaciones en cultivo in vitro y control de endófitos), etc. Asesoramiento en el diseño de estrategias para el control y la prevención de enfermedades bacterianas y fúngicas en cultivos y en viveros. Recomendación en el uso de fungicidas, bactericidas, saneamiento y desinfección. Este servicio se puede conectar con la evaluación in vitro, ex vivo o in planta de la eficacia de los compuestos antimicrobianos o desinfectantes más adecuados, con especial atención programa de producción integrada o ecológica de la empresa o cooperativa.
SISTEMAS DE PREVISIÓN Y ASESORAMIENTO EN PROGRAMAS DE PROTECCIÓN INTEGRADA DE CULTIVOS (PIC)
Este servicio incluye el análisis del riesgo de infección mediante sistemas de predicción de la gestión de enfermedades para minimizar el uso de pesticidas (fungicidas o bactericidas). Tenemos experiencia en el desarrollo de modelos de predicción de enfermedades basados en el efecto de la temperatura-humedad, en la intensidad de la enfermedad y en la evaluación y la validación (mancha parda de pera, moteado del manzano, bacteriosis del nogal y fuego bacteriano). Estos sistemas se pueden utilizar para la cartografía de riesgo de enfermedades en un área geográfica determinada, para ayudar en el muestreo de control de enfermedades o para programar aplicaciones de pesticidas.
ESTUDIOS PRELIMINARES DE TOXICOLOGíA
En el proceso de desarrollo de un biopesticida es importante disponer de datos preliminares sobre una posible toxicidad. Ofrecemos una plataforma para el estudio de la fitotoxicidad y la toxicidad y genotoxicidad animal. Las pruebas de fitotoxicidad se basan en infiltraciones en hojas de tabaco, alcalinización de cultivos de células de tabaco, germinación de polen; la toxicidad animal determina DL50 y MLD en el nematodo Caenorhabditis elegans y la genotoxicidad mediante el test de Ames utilizando cepas de Salmonella. Estos ensayos no son un sustituto de las pruebas reglamentarias que se necesitan para el registro de un pesticida, sino que son una guía para seleccionar los ingredientes o formulaciones activas líderes en fase de desarrollo.